針對5/2中央農委會主委陳吉仲一聲命令要求5/3凌晨零點，欲進入北農第一果菜市場進行拍賣作業的拍賣員、承銷人及其他從業人員必須快篩陰性始得進入該市場，但卻至5/3凌晨前都未將足夠快篩試劑送至北農，還是郭昭巖議員於111/5/2警衛部門質詢時，針對北農相關防疫作為質詢，要求市府定要協助提供全市批發市場足夠篩劑以因應，衛生局才緊急調配4000多劑試劑至北農。但因中央政策佈達倉促，即便北市衛生局已因郭議員質詢緊急調派試劑，卻因北農人手臨時不足、無法負荷如此大量現場快篩作業，只能改以現場發送試劑讓相關從業人員回去篩檢，然後5/4凌晨再持此篩檢結果進入拍賣場，引起承銷人等大反彈。郭昭巖議員認為中央命令倉促又配套不及不足政策會議不明下，造成市場普遍爭議地方政府措手不及，實不利病毒圍堵與防疫工作推行。北市府應極力向中央反映爭取足夠即時防疫物資和人力與經費支援，以避免疫情擴散、重蹈去年疫情大爆發事件。
郭昭巖議員在5/2議會警政部門質詢表示，國內新冠肺炎疫情持續延燒，28日起連續4天突破1萬例本土個案，5/1更高達1萬6936例本土病例，中重症新增47人另有3人病逝，加上北農30日確診人數單單在第一果菜市場於30日竟高達181人，令人膽戰心驚。郭昭巖唯恐北市批發市場重演去年疫情大爆發事件，故要求市府必須盡快行文中央，要求在民間快篩試劑一劑難求下，中央應撥給足夠快篩試劑給北市的所有批發市場以利及時篩檢及時圍堵病毒再進入拍賣市場所造成的感染擴大。因這幾個批發市場不僅肩負大台北地區穩定供應民生物資重責，而且必須保障物資和場域的安全維護。
郭昭巖並表示，陳吉仲主委在5/2中午緊急宣布5/3凌晨所有進入北農第一果菜市場拍賣所有從業人員必須快篩陰性始得進入拍賣場作業，不但未清楚告知大家是一天一篩還是一次篩檢可以抵幾天的結果，並遲至郭議員5/2下午五點質詢時，還未撥給足夠快篩試劑給北農，在無配套措施和足夠試劑人力支援下，容易造成防疫及拍賣作業大混亂。
截至30日止，第一和第二果菜市場和魚市場快篩試劑庫存量分別是810劑和700劑左右，根本不夠5/3凌晨拍賣市場內相關人員進行快篩。她要求市府儘快行文至中央索取試劑給所有北市批發市場外，也要再電話催促務必在5/3凌晨時讓所有進入拍賣場從業人員能有足夠快篩試劑篩檢，以利拍賣工作順利進行。
郭昭巖並指出，中繼市場因為臨時建物辦公空間密閉狹小容易致同仁間交叉感染。因不只第一果菜市場確診人數高達181人，魚市場61人、家禽5人、而第二果菜市場目前雖然是19人卻需至第一果菜市場做支援也增加往返感染風險。
又拍賣場內彼此密切接觸，拍賣員傳染給承銷人，承銷人回到零批場後傳染給其他攤商，接著就很可能傳給消費者，一不小心就容易造成全市大感染。故除要求市府協助向中央反映足夠快篩試劑以讓市場內相關從業人員適時篩檢，市府也應就果菜公司同仁上班如何做分艙分流辦公避免交叉感染。
同時，郭昭巖也要求衛生局和聯醫院因藉其專業來指導督察市府或魚果菜公司聘請的清潔公司如何做到確實有效的清消以防堵病毒。
她更要求北農和市府應研議如何在拍賣程序中的電子簽章簡化程序分散人流，以避免承銷人群聚研議對策以避免群聚感染，畢竟病毒變異傳染的速度實在太快了！郭昭巖還要求市府及北農和漁產公司需要將相關防疫措施的內容和施行細則盡快讓五大公會充分明瞭，以利批發市場做好防疫工作避免疫情再擴散，畢竟，台北市已經不起二次封城。